Költő, prózaíró, drámaíró, tanulmány- és esszéíró, műfordító.
Első versei a kolozsvári Utunkban (1990-től Helikon) jelentek meg. Költészete a Nyugat nagy mestereinek nyomdokain indult el, Babits Mihály, Tóth Árpád, Szabó Lőrinc voltak a mesterei.
Írói arculatát döntően határozta meg filozófiai műveltsége, sajátos bölcselete. Indulásától kezdve szemben állt a hatalom, a hivatal rövidlátó, sok esetben embertelen politikai gyakorlatával. Fölényes biztonsággal találta meg azt a költői jelbeszédet, melynek birtokában bátran mondhatta a maga különvéleményét mindarról, ami megalázta az embert. Nem befolyásolták a kor irodalom-politikai törekvései, életművét a polgári humanista értékrend és a szenvedélyes igazságkeresés alakította. Nem hódolt be a mindenkori hatalomnak, hanem ragaszkodott az egyetemes emberi értékekhez.
Lengyel Balázs író és kritikus emlékező írásában a legmagasabbra értékelte: „Egy biztos számomra, hogy Székely János nemcsak a határokon túli, az úgynevezett kisebbségnek, hanem egyetemes írója századunknak, századunk második felének. Valahol Camus és Orwell között. Egyike korunk legnagyobbjainak.”
Díjai:
Alföld-díj (1991)
Életében megjelent kötetei:
Új képes krónika. Drámák. Dacia, Kolozsvár, 1991
Dózsa. Poéma. Kriterion, Bukarest, 1989
Az árnyék. Soó Péter bánata. A nyugati hadtest. Magvető, Budapest, 1988
A mítosz értelme. Esszék. Kriterion, Bukarest, 1985
A nyugati hadtest. Variációk indulótémára. Kriterion, Bukarest, 1979
Képes krónika. Drámák. Magvető, Budapest, 1979
Egy rögeszme genezise. Esszék és bírálatok. Kriterion, Bukarest, 1978
Székely János legszebb versei. Albatrosz, Bukarest, 1975
Egy láda anyag. Válogatott versek. 1949-1970. Eminescu, Nagyvárad, 1973
A hallgatás tornya. Válogatott versek 1949-1970. Eminescu, Bukarest, 1972
Az árnyék. Soó Péter bánata. Kriterion, Bukarest, 1972
Maradék. Versek 1954–1968. Irodalmi, Bukarest, 1969
Gyermekkorom ösvényei. Ifjúsági, Bukarest, 1967
A virágok átka. Versek. Irodalmi, Bukarest, 1966
Dózsa. Poéma. Irodalmi, Bukarest, 1964
Küldetések. Versek. Ifjúsági, Bukarest, 1962
Itthon vagyok. Lírai riport. Irodalmi, Bukarest, 1961
Mélyvizek partján. Állami Irodalmi és Művészeti, Bukarest, 1957
Csillagfényben. Állami Irodalmi és Művészeti, Bukarest, 1955
Posztumusz kötetek:
A valódi világ; Osiris–Századvég, Budapest, 1995
A virágok átka. Válogatott versek; válogatta és az előszót írta: Lászlóffy Aladár; Magyar Írószövetség–Belvárosi, Budapest, 1998 (Bibliotheca Hungarica)
Székely János összes drámái; Polis, Kolozsvár, 1999
A nyugati hadtest. Variációk indulótémára; 2. kiadás; Mentor, Marosvásárhely, 2004
Szerelem Székely János versei; válogatta és összeállította: Kőrössi P. József; Noran, Budapest, 2006
Három dráma; Mentor, Marosvásárhely, 2009
Válogatott művek; vál., jegyz. Verebes István; Magyar Közlöny Lap- és Könyvkiadó, Budapest, 2016 (Nemzeti könyvtár)
Válogatott versek; vál., szerk. Fekete Vince; Székelyföld Alapítvány, Csíkszereda, 2018 (Székely könyvtár)